Σε καμία περίπτωση το ΔΕΕ δεν πρέπει να συγχέεται με το Ευρωπαϊκό Δικαστήριο Ανθρωπίνων Δικαιωμάτων, το οποίο δεν αποτελεί όργανο της ενώσεως αλλά υπάγεται στο Διεθνή Οργανισμό, Συμβούλιο της Ευρώπης, και συστήθηκε με την Ευρωπαϊκή Σύμβαση των Ανθρωπίνων Δικαιωμάτων. για να διασφαλίσει την εφαρμογή της εν λόγω Συμβάσεως. Παρόλα αυτά, η νομολογία που εκπονείται από το ΕΔΑΔ μπορεί να επηρεάσει σημαντικά το δίκαιο της ΕΕ, καθώς η Ευρωπαϊκή Σύμβαση συνιστά επίσης γενική αρχή του δικαίου της ΕΕ, βάσει του άρθρου 6 και διάταξης 2 της ΣΕΕ.
Ένας εκτελεστικός μηχανισμός, όπως αυτός της επιτροπής ή του ευρωπαϊκού κοινοβουλίου, δεν είναι αρκετός για την ανάγκη μιας υψηλού βαθμού πειθαρχίας που απαιτείται στο ευρωπαϊκό οικοδόμημα, όπως αυτό ιδρύθηκε, εξελίχθηκε και ως προς την κατεύθυνση που μοιάζει ότι θα εξελιχθεί. Όμως δεν είναι αρκετό ούτε ένα τυπικό δικαστικό σώμα, που απλώς συγκροτείται και παρακάθεται στις υποθέσεις που προωθούνται ενώπιον του.
Ο πολύπλοκος αυτότροφος πολιτικός χαρακτήρας της ενώσεως, οι ποικίλες σχέσεις μεταξύ των κρατών-μελών αλλά και η πλήρης αντιστοιχία του ΔΕΕ, ως δικαιοδοτικού ενωσιακού οργάνου με τα εθνικά δικαιοδοτικά όργανα, αναγάγουν την αναγκαιότητα για ένα ισχυρό πλέγμα κυκλικής αλληλεπίδρασης.
